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专家人才

  • 姓名: 聂金福
  • 性别: 男
  • 职称: 正高级工程师
  • 学历: 博士
  • 电话: 
  • 传真: 
  • 电子邮件: nie_jinfu@gibh.ac.cn
  • 通讯地址 广州市科学城开源大道190号

    简历:

  • ·         跨学科的科研,教学及个体化医疗实际工作经验

    ·         跨国公司的产品开发,生产,质量控制,销售和企业管理经验

    ·         发表24篇高水平科学论文,平均影响因子8.6 ,  他引4000余次。

    ·         16年生物及医疗信息学工作,具备丰富的数据分析、数据可化和生物信息工具的开发及应用经

    ·         4年精准医疗科研及临床分析解读验,领导的生物信息团队帮助梅奥科研人员发表近百篇高水平论文

    ·         高通量云算方面有丰富的,对多个分布式算系有深入的了解(LSFPBSSGE,和Condo

    ·         熟悉人基因组和肿瘤临床疾病的共享数据库

    ·         化学和计算机双硕士

     

    中国科学院广州生物医药与健康研究院,广州(2018-至今)

    超算中心正高级工程师

               

    生物信息分析团队负责人(2013 - 2016

    梅奥所个体化医学中心,美国明尼苏达州 罗切斯特市

    ·         组建壮大生物信息分析团队由7人发展到30

    ·         改写ChIP-Seq自动化分析软件,使分析时间从18小时降到2小时以内

    ·         开发ChIP-SeqRNA-Seq的自动化整合软件,该软件被广泛应用于梅奥临床样品的分析

    ·         第一作者发表RNA-Seq基因表达的完整性评分系统,这一系统可以有效纠正由于RNA样本的降解(如FFPE样品)引起的表达偏差

     

    生物信息客座研究员 (2011 - 2015)

    中国科学院广州生物医药与健康研究院,广州

    ·         策划并实施生物信息学研究团队的建设,包括生物信息计算机资源的配置和软件的应用

    ·         为多篇高水平科技论文包括Nature methodNature Genetic 提供了关键性的生物信息支持。 

     

    资深计算生物专家(2006 - 2012

    威斯康辛大学,莫格里奇研究院 再生生物学中心。 威斯康辛州,麦迪逊市

    ·         帮助中心组建生物信息学研究团队

    ·         为划时代的人类首次诱导干细胞的研究提供关键性的生物信息支持,成果发表在2007 年《科学》杂志

    ·         与实验室科学家密切合作开发高通量的单细胞基因测序技术

    ·         优化Illumina的数据处理软件使其能够应用于自制DNA文库的分析

    ·         设计NimbleGen高分辨率CGH芯片 检测在诱导干细胞编辑过程中的CNV 变化

    ·         开发TF -Cluster工具,可以通过多个样本的基因表达数据鉴定基因控制的生物组群

     

    级应用软件开发团队负责人2000 - 2005

    威斯康星医学院生物信息学研究中心 威斯康星州,密尔沃基市

    ·         开发VCMAP(比较基因组学工具),广泛应用于工业界和学术界

    ·         VCMAP构建大鼠,小鼠和人类基因组的比较基因组学图谱

    ·         建立大鼠高密度辐射杂交图(RHMAP), 并成功应用于大鼠的基因组的组装

    ·         建立一个高性能的60节点集群计算系统,用于大鼠基因组的注释和分析

    ·         开发基因注释工具允许用户从多个数据库中检索信息,包括Swiss-Prot、LocusLink,UCSC,和KEGG

    ·         UCSC合作维护安装在威斯康星医学院的UCSC基因组浏览器镜像站点

     

    发部经理,厂长,副总经理(1993 - 1998

    康化工有限公司(ECOLAB, LLC)/来今化工有限公司, 中国,上海

    ·         在中国市场开发和推出了200多个化工产品

    ·         组织申报并成为中国首例通过ISO9001资格认证的化工企业

    环境管理系讲师,山西经济管理学院  山西 太原 (1985-1987 1990-1993)

          组建环境管理系并教授第一届学生

     

    计算机及数理统计硕士: 1998-2000,  Marquette University, Milwaukee, WI. USA

    环境化学硕士: 1987-1990, 河北大学, 河北省保定市

    化学学士: 1981-1985, 山西大学, 山西省太原市

    研究领域:

  • 精准医疗,生物医学信息学域的高通量基因数据的分析,整合,解和管理

    承担科研项目情况:

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    社会任职:

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    获奖及荣誉:

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    代表论著:

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