1999.9-2003.7 江西师范大学 应用化学专业 理学学士
2003.9-2009.1 中国科学院大连化学物理研究所 分析化学专业 理学博士
2010.1-2011.10 中国科学院大连化学物理研究所 助理研究员
2011.11-2020.6 中国科学院大连化学物理研究所 副研究员
2020.7-2021.6 中国科学院大连化学物理研究所 项目研究员
2021.7-2025.4 中国科学院大连化学物理研究所 研究员
2025.4-至今 中国科学院广州生物医药与健康研究院 研究员/课题组长
细胞是生命活动的基本单元，其功能的异质性以及细胞间通讯是维持组织稳态、调控发育和疾病发生的关键机制。近年来，单细胞组转录组测序技术已揭示了细胞在核酸层面的异质性，并构建了细胞谱系分化轨迹，为理解发育、再生和肿瘤异质性提供了重要工具。但蛋白质组、代谢组（胞内功能核心）及分泌组（胞间通讯关键）的异质性研究仍面临技术挑战，严重制约对细胞功能多样性及互作网络的系统性解析。本实验室围绕细胞谱系组学技术开发需求，主要开展以下研究：
（1）微量/单细胞样本前处理材料、技术及相关仪器的创制
（2）基于LC-MS的单细胞/空间多维度多组学分析
（3）细胞外囊泡（EV）分离富集技术，以及参与细胞间通讯的配体-受体细胞蛋白质组深度覆盖精准解析
（1）国家重点研发计划课题（2024YFC3405401）， 多维度单细胞与空间蛋白质组分析技术，2024-2027，在研，课题负责人
（2）国家重大科学仪器与设备开发专项课题（2012YQ12004402），在线蛋白质预处理系统，2012-2017，结题，课题负责人
（3）国家自然科学基金面上项目（21974136），基于液质联用的单细胞分泌蛋白质组定量分析新方法，2020-2023，结题，项目负责人
（4）国家自然科学基金面上项目（22374146），面向移植胚胎无创质量评估的细胞外囊泡蛋白质组-代谢组分析新方法， 2024-2027, 在研，项目负责人
（5）国家自然科学基金青年项目（21105009），用于膜蛋白质组样品高通量预处理的串级膜接口与平行酶反应器的集成化方法研究，2012-2014，结题，项目负责人
（6）国家重点研发计划课题（2017YFA0505002）基于高效标记和特征肽段的蛋白质组精准定量技术,2017-2022，结题，子课题负责人
（7）国家重点研发计划课题（2018YFC0910202）蛋白组学数据质量控制关键技术研发与应用示范，2018-2020，结题，子课题负责人
（8）辽宁省应用基础研究计划（2023JH2/101300126），基于肺泡灌洗液外泌体的早期肺癌体外诊断标志物筛选及应用，2023-2024，在研，项目负责人
（9）大连化物所创新研究基金（DICP I202143）面向临床应用的干细胞外泌体膜法规模化制备及质量评价体系研究，2022-2023，结题，项目负责人
（10）国家自然科学基金委重大项目（21991083），细胞中重要调控蛋白质的发现和原位相互作用的分析新方法，2020-2024，结题，项目骨干
HPLC国际会议科学委员常务委员会“青年科学家奖”（2011年）
中国仪器仪表学会朱良漪分析仪器创新奖“青年入围奖”（2020年）
入选第二批中国科学院特聘研究骨干岗位（技术攻坚类）
入选大连市“兴连英才计划”高层次人才（2024年）
(1) Yingyun He#,Xinxin Liu#, Fengjiao Zhu,Zhongpeng Dai,Xiao Li,Linmei Li,Baofeng Zhao,Huiming Yuan*,Yao Lu，Zhen Liang,Yukui Zhang,Lihua Zhang*. Single-Cell Secretome Profiling Enabled by Selective Enrichment and NanoLC-MS/MS Analysis. Angew. Chem. Int. Ed. 2025,64,e202417351.
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(3) Yingyun He,Huiming Yuan*,Yu Liang,Xinxin Liu,Xiaozhe Zhang,Yahui Ji,Baofeng Zhao,Kaiguang Yang,Jue Zhang,Shen Zhang,Yukui Zhang,Lihua Zhang*. On-capillary alkylation micro-reactor: A facile strategy for proteo-metabolome profiling in the same single cells. Chem. Sci. 2023,14,13495-13502.
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